Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trerf1Q8BXJ2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms