Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Vps13cQ8BX70 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Vps13cQ8BX70 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Vps13cQ8BX70 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Vps13cQ8BX70 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Vps13cQ8BX70 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Vps13cQ8BX70 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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