Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slx1bQ8BX32 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx1bQ8BX32 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms