Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU4

Clec9a, C-type lectin domain family 9 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec9aQ8BRU4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Clec9aQ8BRU4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec9aQ8BRU4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms