Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms