Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdca8Q8BHX3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms