Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gabra5Q8BHJ7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra5Q8BHJ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms