Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot10Q8BH15 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms