Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms