Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo2Q7TSY8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms