Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf516Q7TSH3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms