Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms