Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ScocQ78YZ6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScocQ78YZ6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms