Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnih3Q6ZWS4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms