Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC1

Dhx29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx29Q6PGC1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx29Q6PGC1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dhx29Q6PGC1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms