Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms