Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms