Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms