Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frem2Q6NVD0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms