Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms