Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms