Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms