Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms