Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd180Q62192 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd180Q62192 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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