Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms