Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lamb3Q61087 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms