Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms