Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms