Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClpbQ60649 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms