Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc3Q5DU56 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrc3Q5DU56 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms