Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt2Q5DTW2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt2Q5DTW2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms