Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WhammQ571B6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms