Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms