Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc27a5Q4LDG0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms