Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms