Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms