Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnga4Q3UW12 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga4Q3UW12 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms