Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef40Q3UPH7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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