Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skap2Q3UND0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms