Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TchpQ3TVW5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms