Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms