Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lingo4Q149C3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lingo4Q149C3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lingo4Q149C3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Lingo4Q149C3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Lingo4Q149C3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Lingo4Q149C3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Lingo4Q149C3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms