Protein–RNA interactions for Protein: Q12233

ATP20, ATP synthase subunit g, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 115 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATP20	Q12233	YPL225W	YPL225W	441 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	AI1	Q0050	2505 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	PCC1	YKR095W-A	267 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	FYV7	YLR068W	456 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	YPL068C	YPL068C	882 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	YLR456W	YLR456W	615 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	RPL35A	YDL191W	363 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	ULI1	YFR026C	510 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	YNL303W	YNL303W	348 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	MRPL50	YNR022C	420 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	NIP1	YMR309C	2439 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	YLR334C	YLR334C	381 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	YNL122C	YNL122C	348 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	YNR025C	YNR025C	360 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
ATP20	Q12233	YLR101C	YLR101C	396 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	RPS25B	YLR333C	327 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	YOR029W	YOR029W	336 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	YLR232W	YLR232W	348 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	YKU70	YMR284W	1809 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	YHR007C-A	YHR007C-A	216 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	snR41	snR41	95 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	YJL120W	YJL120W	324 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	COY1	YKL179C	2040 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	YHR138C	YHR138C	345 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	TOM22	YNL131W	459 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	YPR092W	YPR092W	306 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
ATP20	Q12233	YCR022C	YCR022C	345 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	YKL136W	YKL136W	399 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	YLR282C	YLR282C	342 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	SOV1	YMR066W	2697 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	RPS30B	YOR182C	192 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	STE5	YDR103W	2754 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	snR8	snR8	190 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	YEL073C	YEL073C	324 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	snR128	snR128	126 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	YAR029W	YAR029W	225 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	snR45	snR45	172 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
ATP20	Q12233	MYO1	YHR023W	5787 nt		-0.28	□□□□□ -2.46
ATP20	Q12233	BUL2	YML111W	2763 nt		-0.28	□□□□□ -2.46
ATP20	Q12233	YDR354C-A	YDR354C-A	144 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
ATP20	Q12233	VPS20	YMR077C	666 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
ATP20	Q12233	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
ATP20	Q12233	CSN9	YDR179C	489 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
ATP20	Q12233	YJL026C-A	YJL026C-A	222 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
ATP20	Q12233	THO2	YNL139C	4794 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	SNU13	YEL026W	381 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	YER078W-A	YER078W-A	165 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	YOR161W-A	YOR161W-A	81 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	PRM3	YPL192C	402 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	BLI1	YKL061W	342 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	YLR434C	YLR434C	384 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	tF(GAA)B	tF(GAA)B	73 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	tF(GAA)F	tF(GAA)F	73 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	tF(GAA)G	tF(GAA)G	73 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	tF(GAA)H1	tF(GAA)H1	73 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	tF(GAA)H2	tF(GAA)H2	73 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	tF(GAA)M	tF(GAA)M	73 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	tF(GAA)P1	tF(GAA)P1	73 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	tF(GAA)P2	tF(GAA)P2	73 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	YGL123C-A	YGL123C-A	231 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	HTB2	YBL002W	396 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	YDR366C	YDR366C	399 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	YEL020C-B	YEL020C-B	198 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	YKL100W-A	YKL100W-A	90 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
ATP20	Q12233	YLR041W	YLR041W	321 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	RPS27B	YHR021C	249 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	YPL205C	YPL205C	345 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	YAR053W	YAR053W	297 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	CSE2	YNR010W	450 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	CSE1	YGL238W	2883 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	YBR099C	YBR099C	384 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	YJL007C	YJL007C	315 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	ATP19	YOL077W-A	207 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	PRP39	YML046W	1890 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	YDL158C	YDL158C	309 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	YOL014W	YOL014W	375 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
ATP20	Q12233	YDR210W	YDR210W	228 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	YFL063W	YFL063W	456 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	YLR406C-A	YLR406C-A	150 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	EST1	YLR233C	2100 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	STF2	YGR008C	255 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	YLR202C	YLR202C	327 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	GLG1	YKR058W	1851 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	RAD61	YDR014W	1944 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	YDR048C	YDR048C	315 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	TFB5	YDR079C-A	219 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	YKL063C	YKL063C	504 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
ATP20	Q12233	YER137W-A	YER137W-A	306 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
ATP20	Q12233	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
ATP20	Q12233	YLL019W-A	YLL019W-A	93 nt		-0.55	□□□□□ -2.5

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms