Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms