Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MestQ07646 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MestQ07646 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MestQ07646 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MestQ07646 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MestQ07646 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MestQ07646 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms