Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 FMP27YLR454W 7887 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 STF2YGR008C 255 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YAR029WYAR029W 225 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YLR202CYLR202C 327 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YMR321CYMR321C 318 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 Q0017Q0017 162 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 YBR285WYBR285W 435 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG17Q06410 VIK1YPL253C 1944 nt0.27□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 PRP42YDR235W 1635 nt0.27□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 ESP1YGR098C 4893 nt0.26□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 snR190snR190 190 nt0.25□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 YHR138CYHR138C 345 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 YJR157WYJR157W 363 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 YNL324WYNL324W 396 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 YOR121CYOR121C 306 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 YOR345CYOR345C 351 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 ULP2YIL031W 3105 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 AGA2YGL032C 264 nt0.23□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.22□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.22□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.22□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 MLP1YKR095W 5628 nt0.22□□□□□ -2.37
ATG17Q06410 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.21□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 RPL35AYDL191W 363 nt0.21□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.21□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 HTB2YBL002W 396 nt0.21□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 HUG1YML058W-A 207 nt0.21□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 SSS1YDR086C 243 nt0.2□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 YAR053WYAR053W 297 nt0.2□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.2□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 MYO1YHR023W 5787 nt0.2□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.19□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.18□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.18□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 LEE1YPL054W 906 nt0.18□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 ORC3YLL004W 1851 nt0.18□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 RPS26AYGL189C 360 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 UTP20YBL004W 7482 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 COG8YML071C 1824 nt0.15□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 RCO1YMR075W 2055 nt0.15□□□□□ -2.38
ATG17Q06410 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 NNF2YGR089W 2811 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 MLP2YIL149C 5040 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 IQG1YPL242C 4488 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 ULI1YFR026C 510 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 TRS65YGR166W 1683 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 AI1Q0050 2505 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YLR282CYLR282C 342 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YNL146WYNL146W 303 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YPR092WYPR092W 306 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YDR048CYDR048C 315 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YKL136WYKL136W 399 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 YCR022CYCR022C 345 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 NIP1YMR309C 2439 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 BIR1YJR089W 2865 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG17Q06410 RPS27BYHR021C 249 nt0.09□□□□□ -2.4
ATG17Q06410 BIL1YOR304C-A 231 nt0.09□□□□□ -2.4
ATG17Q06410 COY1YKL179C 2040 nt0.09□□□□□ -2.4
ATG17Q06410 BUL2YML111W 2763 nt0.09□□□□□ -2.4
ATG17Q06410 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.06□□□□□ -2.4
ATG17Q06410 YGR035CYGR035C 351 nt0.05□□□□□ -2.4
ATG17Q06410 COX12YLR038C 252 nt0.04□□□□□ -2.4
ATG17Q06410 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.04□□□□□ -2.4
ATG17Q06410 CSE2YNR010W 450 nt0.03□□□□□ -2.4
ATG17Q06410 YOL014WYOL014W 375 nt0.03□□□□□ -2.4
ATG17Q06410 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.02□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.02□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 STE5YDR103W 2754 nt0.01□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.01□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.01□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 YLR041WYLR041W 321 nt0□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 YKU70YMR284W 1809 nt-0.01□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 snR60snR60 104 nt-0.03□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 YEL073CYEL073C 324 nt-0.03□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 YFL063WYFL063W 456 nt-0.03□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 BLI1YKL061W 342 nt-0.03□□□□□ -2.41
ATG17Q06410 SOV1YMR066W 2697 nt-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.9 ms