Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39Q06138 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms