Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Caprin2Q05A80 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Caprin2Q05A80 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Caprin2Q05A80 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Caprin2Q05A80 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Caprin2Q05A80 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Caprin2Q05A80 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Caprin2Q05A80 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Caprin2Q05A80 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Caprin2Q05A80 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Caprin2Q05A80 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms