Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox9Q04887 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox9Q04887 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms