Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcqQ02111 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcqQ02111 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms